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物流中心的運輸功能和一般的運輸功能的相同之處在于同是作為社會生產力的有機組成部分，主要是通過完成物品的空間位移來實現商品的增值。但物流中心的運輸管理又與一般的運輸管理有所區別，這主要表現在以下幾方面： 

1.強調運輸的協調性。 

物流中心一般是處于物流的末端環節的流轉節點，它所體現的價值在于有效連接供應與需求方的運作。物流中心的運作在于節奏的控制，不是越快越好，更不是越慢越好，而是尋求順暢的流動過程的最低成本。運輸的協調包括運輸工具的選擇，與供應和需求方的時間協調，運輸方法協調等等。 

2.路線優化與合理性。 

物流中心服務于眾多的客戶是其實現價值的前提，客戶小批量訂貨于物流中心大批量運輸的利益驅動要求物流中心的運輸在同一輛車中裝載多家的貨品。運輸的路線優化是實現物流中心單位貨品運輸距離最短的有利手段。同時物流中心又是多品種的貨品集散地，如何實現商品類別的搭配，以達到車輛裝載重量和體積的合理化也是物流中心運輸管理任務之一。 

3.消除物流中心功能間的背反效應。 

物流中心是眾多服務功能的集成，功能越多，所創造的價值也越大，但物流功能之間的背反效應也要考慮。存貨控制要按經濟批量訂貨，要考慮供貨商的訂貨價格因素。倉儲部門要求整托板裝卸貨，不希望出現零散貨品，這些都與運輸管理的裝滿車運輸的要求目標相矛盾。如何平衡各功能間的利弊，以求得整體效益的最大化是物流中心運輸管理的內容之一。 

4.多溫度運輸。 

服務于現代商業及大型連鎖店的物流中心是物流中心的典型實例，也代表著當代物流中心發展的整體趨勢與水平。由于連鎖超市中溫控食品及速凍食品的比例提高，冷凍冷藏運輸也成了食品物流中心運輸的不可缺少的部分。如何實現冷凍冷藏貨品的有效運輸，即能滿足客戶對送貨及時，便利的要求，又能達到物流中心運輸滿車滿載的要求，是物流中心運輸管理的一部分。